水生态修复系统是一种采用强化激活微生物群落构建河湖水体优良生态系统的专用修复设备。利用河湖水体土著活性生物菌，投放接种至本系统设备中，以原水体作为活化基质，经过稳态条件以及生物活化制剂的配合作用进行驯化培养，提升微生物代谢活性，催生高效的生化效果，将最终强适应性的高活性修复型微生物介质大量扩充，重新输入原河湖水体中并以此开始水体内源修复处置过程。 经多个循环周期后，本修复系统可将目标水体构建成具备良好自我净化能力的高效微生物生态修复体系，最终实现河湖水体的原位修复成果。